Transcript #00000003

Transcript name adenomatous polyposis coli, transcript variant 1
Gene name APC (APC regulator of WNT signaling pathway)
Chromosome 5
Transcript - NCBI ID NM_001127511.2
Transcript - Ensembl ID -
Protein - NCBI ID NP_001120983.2
Protein - Ensembl ID -
Protein - Uniprot ID -
Remarks -


Variants

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Affects function     

Exon     

AscendingDNA change (cDNA)     

RNA change     

Protein     
+/+ - c.(?) r.(?) p.(?)
+/+ - c.(?) r.(?) p.(?)
+/+ - c.(?) r.(?) p.(?)
+/+ - c.(?) r.(?) p.(?)
+/+ - c.? r.0 p.0
+/+ - c.? r.0 p.0
+/+ - c.? r.0 p.0
?/? - c.166-11421A>G r.(=) p.(=)
?/? - c.166-48T>C r.(=) p.(=)
-?/-? - c.166-18T>C r.(=) p.(=)
?/? - c.213T>C r.(=) p.(=)
?/? - c.227T>C r.(?) p.(Ile76Thr)
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-?/-? - c.251-29G>C r.(=) p.(=)
-?/-? - c.251-29G>C r.(=) p.(=)
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?/? - c.251-27A>C r.(=) p.(=)
?/? - c.307C>G r.(?) p.(Leu103Val)
?/? - c.337G>C r.(?) p.(Val113Leu)
?/? - c.337G>C r.(?) p.(Val113Leu)
+/+ - c.371del r.(?) p.(Pro124Leufs*11)
?/? - c.452+4A>G r.spl? p.?
?/? - c.452+37A>C r.(=) p.(=)
-?/-? - c.453-17T>A r.(=) p.(=)
-?/-? - c.453-17T>A r.(=) p.(=)
-?/-? - c.453-17T>A r.(=) p.(=)
-?/-? - c.453-17T>A r.(=) p.(=)
-?/-? - c.453-17T>A r.(=) p.(=)
-?/-? - c.489G>A r.(=) p.(=)
+/+ - c.539_542del r.(?) p.(Asp180Valfs*4)
+/+ - c.539_542del r.(?) p.(Asp180Valfs*4)
+/+ - c.550_553del r.(?) p.(Thr185Lysfs*9)
?/? - c.561+45G>A r.(=) p.(=)
?/? - c.562-37C>T r.(=) p.(=)
?/? - c.562-30T>C r.(=) p.(=)
?/? - c.562-19_562-17del r.(=) p.(=)
+/+ - c.562-1G>A r.spl? p.?
+/+ - c.562-1G>A r.spl? p.?
+/+ - c.562-1G>A r.spl? p.?
+/+ - c.667C>T r.(?) p.(Arg223*)
+/+ - c.676-8785C>T r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
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-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-8774A>G r.(=) p.(=)
?/? - c.676-8729G>C r.(=) p.(=)
?/? - c.676-37_676-26del r.(=) p.(=)
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-?/-? - c.676-22G>C r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-22G>C r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-22G>C r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-22G>C r.(=) p.(=)
-?/-? - c.676-22G>C r.(=) p.(=)
+/+ - c.676_677del r.(?) p.(Arg226Valfs*7)
-?/-? - c.702C>T r.(=) p.(=)
-?/-? - c.705C>G r.(=) p.(=)
?/? - c.721C>T r.(?) p.(Arg241Trp)
?/? - c.780+5A>G r.spl? p.?
+/+ - c.781-8A>G r.(=) p.(=)
?/? - c.879+19C>T r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
-/- - c.879+30A>G r.(=) p.(=)
+/+ - c.1180C>T r.(?) p.(Gln394*)
?/? - c.1186C>T r.(?) p.(Arg396Cys)
+/+ - c.1209G>A r.(?) p.(Trp403*)
+/+ - c.1258+1G>C r.spl? p.?
?/? - c.1258+23C>A r.(=) p.(=)
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